傅里叶红外光谱仪利用红外光谱方法可测定分子的键长和键角，并由此推测分子的立体构型。根据所得的力常数可推知化学键的强弱，分子中的某些基团或化学键，由于分子内和分子间相互作用，有机官能团的特征频率会由于官能团所处的化学环境不同而发生微细变化，这为研究表征分子内、分子间相互作用创造了条件。在不同化合物中所对应的谱带波数基本上是固定的或只在小波段范围内变化，因此许多有机官能团例如甲基、亚甲基、羰基，氰基，羟基，胺基等等在红外光谱中都有特征吸收。
该仪器主要用于化学领域、生物领域和环境领域，受到各行各业专业人士的青睐和喜爱。除了用于某些数据分析和记录外，他们也可以使用它。高性能使得某些预设和操作非常方便，应用于染织工业、环境科学、生物学、材料科学、高分子化学、催化、煤结构研究、石油工业、生物医学、生物化学、药学、无机和配位化学基础研究、半导体材料、日用化工等研究领域。
傅里叶红外光谱仪使用中要注意的几个方面：
一、注意控制好实验室内的温湿度条件
在使用傅里叶红外光谱仪进行测定时，可以通过一些人为的方式和措施来将实验室里的温度和湿度保持在更佳范围，同时还有连接电源的时候要用稳压装置以及接地线，以便能够更好的保护设备以及保证测量的准确性。同时受欢迎的傅里叶红外光谱仪厂家建议实验室的面积不要太大，因为这样对于温湿度的控制会更加容易一些。
二、注意控制实验室内的人数
如果是用的傅里叶红外光谱仪属于单光朿型傅里叶红外分光光度计，那么还要控制实验室内的二氧化碳含量。所以一般要求傅里叶红外光谱仪的实验室内的人数要控制在一定的范围内，不能太多人并且要通风换气保持空气新鲜释放掉多余的二氧化碳，以免影响结果。
叁、注意做干燥除湿的措施
潮湿是傅里叶红外光谱仪的大敌，所以要想办法避免其受潮，不用的时候就应该要把设备放在实验室的比较干燥的位置，并且每周要两次开机半天左右，同时还要开除湿机。尤其是在梅雨季节天气比较潮湿更需要做好这方面的控制，同时要保证所测定的样品本身也是干燥的，可以先放在容器中用其他设备把里面的空气和水分一起抽调，然后再用傅里叶红外光谱仪进行测试。
